Kimi kaynaklar Küçük’ün düşüncelerini toplumsal ve tarihsel analizler üzerinden ifade ettiğini, dini kimliğini açıkça paylaşmadığını belirtiyor. Bu nedenle “Yalçın Küçük Müslüman mı?” sorusu hâlâ merak konusu.
Küçük’ün akademik mirası ve toplumsal yorumları ön planda olsa da, inanç dünyası hakkında kesin bir açıklama yok.